Имеется такая проблема. Есть 2 браузера опера и система открывает все ссылки только во второй опере, причем если нажать "сопоставление типов файлов или протоколов конкретным программам" то в списке протоколов можно выбрать браузер только прописанный в системе. никакой кнопки "обзор" нету.
Тоже самое и с файлами. Если не корректно удалить прогу или переименовать экзешник, то система намертво привязывается к этой проге и на другую смотреть даже не хочет.
Так вот вопрос: как изменить ассоциацию средствами САМОЙ системы, а не конкретной программы?

vec, Про браузеры не понял (два браузера Опера), т.к. Оперу не юзаю, особенностей не знаю, но смысл понятен. Относительно программ, то с каждой программой индивидуально через правку реестра.
Вот например, как .exe файл ассоциировали с проигрывателем WMP, чтобы вернуть ассоциацию пришлось править реестр. Можно этот фикс взять за шаблон. Ссылка на тему здесь.

Ошибка: Файл был удален по истечении максимального срока хранения.

а что вообще этот фикс делал?

Перезалил

Ответ в твоём вопросе.

Правит реестр, возвращая .exe файлам ассоциацию с исполняемыми файлами.